Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms