Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RB1CC1Q8TDY2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RB1CC1Q8TDY2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms