Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A5Q8NCS7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A5Q8NCS7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms