Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP38Q8NB14 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP38Q8NB14 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms