Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TC2NQ8N9U0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TC2NQ8N9U0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms