Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF1Q8N6C5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms