Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C17orf53Q8N3J3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C17orf53Q8N3J3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms