Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms