Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP9Q7RTR0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms