Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMUB2Q71RG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms