Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBS12Q6ZW61 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBS12Q6ZW61 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms