Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG3Q6UXM1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRIG3Q6UXM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms