Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ATL2-207ENST00000443098 775 ntTSL 510.16□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.27e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.137e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.167e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-210ENST00000580380 411 ntTSL 511.93□□□□□ -0.57e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.597e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.277e-13■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 25.42□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 CTTN-214ENST00000532334 481 ntTSL 25.75□□□□□ -1.492e-20■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 IST1-211ENST00000537613 894 ntTSL 29.93□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 IST1-207ENST00000534994 674 ntTSL 59.03□□□□□ -0.969e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 IST1-220ENST00000541918 908 ntTSL 57.08□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 NETO2-203ENST00000562559 1327 ntTSL 35.42□□□□□ -1.541e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 PDK1-205ENST00000431718 728 ntTSL 318.27■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 RFT1-203ENST00000467048 886 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 212.3□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BOLA3-204ENST00000477685 667 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.516e-21■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-213ENST00000522404 550 ntTSL 411.81□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-212ENST00000522095 504 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.949e-11■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-226ENST00000591534 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-219ENST00000491747 2379 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 NOL6-206ENST00000496319 759 ntTSL 37.48□□□□□ -1.216e-21■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 ZC3HAV1-202ENST00000460845 1487 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-205ENST00000461221 5693 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 AGK-202ENST00000465241 988 ntTSL 25.22□□□□□ -1.571e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.643e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.729e-11■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC3.87□□□□□ -1.796e-11■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 MRPS27-210ENST00000520285 486 ntTSL 33.63□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 ALB-210ENST00000504043 422 ntTSL 22.93□□□□□ -1.946e-21■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 ALB-206ENST00000484992 693 ntTSL 21.31□□□□□ -2.26e-21■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 PDK1-204ENST00000416991 699 ntTSL 51.3□□□□□ -2.21e-9■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 TOMM40-205ENST00000589649 731 ntTSL 220.97■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 FAM169A-207ENST00000514215 5954 ntTSL 1 (best)4.78□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 41.1
PRPF8Q6P2Q9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-212ENST00000481980 605 ntTSL 314.64□□□□□ -0.073e-12■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 NUP58-211ENST00000480187 588 ntTSL 213.45□□□□□ -0.263e-12■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-205ENST00000460192 567 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-206ENST00000465354 949 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-208ENST00000493373 624 ntTSL 510.62□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-209ENST00000574109 843 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 NDE1-212ENST00000577101 575 ntTSL 48.14□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.23e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.23e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.533e-16■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-205ENST00000509692 1646 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-202ENST00000274255 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 SKP2-203ENST00000504386 574 ntTSL 56.54□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 511.13□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 LARP4-205ENST00000517559 559 ntTSL 49.54□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.622e-10■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-10■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.812e-10■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.882e-10■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.992e-10■■■■■ 41
PRPF8Q6P2Q9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 APMAP-202ENST00000451442 2117 ntTSL 59.58□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 UTP18-203ENST00000579261 567 ntTSL 52.77□□□□□ -1.976e-9■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 UTP18-206ENST00000583205 664 ntTSL 32.09□□□□□ -2.076e-9■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 TARS-206ENST00000504698 633 ntTSL 36.71□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-30■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-9■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC7-209ENST00000587727 449 ntTSL 312.9□□□□□ -0.344e-13■■■■■ 40.9
PRPF8Q6P2Q9 ADGRG6-207ENST00000463637 498 ntTSL 34.05□□□□□ -1.768e-11■■■■■ 40.9
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 727 ms