Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC70Q6NSX1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC70Q6NSX1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms