Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms