Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WSCD1Q658N2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms