Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP2LQ5T4T6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms