Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NHSL1Q5SYE7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NHSL1Q5SYE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms