Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC158Q5M9N0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC158Q5M9N0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC158Q5M9N0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms