Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1BQ53T94 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1BQ53T94 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1BQ53T94 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1BQ53T94 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms