Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms