Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDNFQ49AH0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDNFQ49AH0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms