Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDRF1Q3B7T1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms