Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IMPG1Q17R60 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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