Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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