Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP4Q15650 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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