Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF1Q15361 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTF1Q15361 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
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