Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3AQ14563 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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