Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
SHROOM2Q13796 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
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SHROOM2Q13796 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
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SHROOM2Q13796 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHROOM2Q13796 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
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SHROOM2Q13796 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
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SHROOM2Q13796 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHROOM2Q13796 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
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