Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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