Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GRIN2BQ13224 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
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