Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCP2Q13094 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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