Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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