Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRN3Q13033 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN3Q13033 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN3Q13033 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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