Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOBRQ0VD83 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms