Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY1Q0D2K3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms