Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms