Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID5AQ03989 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID5AQ03989 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms