Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms