Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU4F1Q01851 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU4F1Q01851 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms