Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK5Q00535 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms