Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNB1P98172 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms