Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKOR1P84550 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms