Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPEP62304 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPEP62304 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms