Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms