Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF3P57682 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF3P57682 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLF3P57682 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLF3P57682 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms