Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBASH3AP57075 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms