Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP1P56182 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRP1P56182 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RRP1P56182 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRP1P56182 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRP1P56182 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RRP1P56182 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1P56182 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1P56182 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRP1P56182 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRP1P56182 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms