Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRKAA2P54646 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKAA2P54646 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms