Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP98P52948 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP98P52948 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP98P52948 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP98P52948 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP98P52948 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP98P52948 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms